win10装lammps

前沿拓展：

win10装lammps

黑屏的原因和处理方法：此问题通常是由显卡驱动程序（双显卡）的兼容性问题引起的。可以尝试关闭电源并多次重新启动计算机。可以在短时间内重复三次后进入winre（Windows恢复环境），但有些用户可能需要直接断开电源。

一、启动后会出法解决问题，可以尝试选择返回到windows疑难解答中的上一个系统还原点，以便系统可以返回到上一个兼容性问题。

跟据过度态理论，体系中某一group原子的扩散系数与均方位移具有以下公式（1）和（2）的关系，公式（1）中r(t)为原子位移，d为维度，t为测量原子扩散的时间。公式（3）为扩散系数与温度T的关系，其中Ea为扩散能垒，kB为波尔滋蔓常数。因此只需要计算一定温度范围内扩散系数与温度的关系，就可以通过公式（3）拟合扩散能垒。

本文笔者将利用LAMMPS以H在Si@SiO2异质结处扩散为例，示范通过过渡态求300K，H扩散系数的过程。同时笔者会给出in文件，读者可经过简单的修改，求出一定温度范围的扩散系数与温度的数值关系从而拟合扩散能垒。

in文件脚本如下：

### Basic setup ###variable t equal 300units metaldimension 3boundary p p patom_style atomicnewton on### Structure ###read_data pos1.datneighbor 1 bincreate_atoms 3 single 5 5 22### Potentials ###pair_style hybrid tersoff lj/cut 10.0pair_coeff * * tersoff SiO.tersoff Si O pair_coeff 1 3 lj/cut 0.0057673 3.1988pair_coeff 2 3 lj/cut 0.0022281 2.8446pair_coeff 3 3 lj/cut 0.001908 2.5711mass 1 28.085mass 2 16mass 3 1.008### Group ###group H type 3### Minimization ###thermo 100thermo_style custom step time vol atoms temp ke pe lx pressfix 1 all box/relax iso 0.0 vmax 0.01min_style cgminimize 1e-25 1e-25 100000 100000### NPT1 ###reset_timestep 0thermo 1000thermo_style custom step dt time atoms temp ke pe vol press lx ly lz velocity all create $t 92137453 dist gaussianfix NPT all npt temp $t $t 1 iso 0.0 0.0 1.0 drag 0.2timestep 0.001run 10000reset_timestep 0compute Msd H msd fix s all vector 1 c_Msd[4]variable MSD equal sum(f_s)/1000 variable stp equal step*dt### NPT2 ###fix msd1 all print 1000 “${stp} ${MSD}” file msd_$t.txt screen nothermo 1000thermo_style custom step temp ke pe vol press lx v_MSDtimestep 0.001run 500000unfix NPT

运行完毕后通过对计算所得MSD与时间得关系进msd_300.txt文件拖入Oringlab行拟合，可得300 K下H在Si@SiO2异质结处扩散系数为8.295 Å2/ps=8.295*108 m2/s。

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PS：由于时间仓促，可能有错误之处，欢迎各位同行交流学习，同时若有疑问、计算技术讨论、合作可以联系笔者邮箱：1924311399@qq.com谢谢！

**推荐：计算运维鸟

拓展知识：

win10装lammps

踏进材料科学的大门的我，需要先安装一些模拟软件：在win10系统中，安装虚拟机virtualbox。在虚拟机中运行CentOS系统，在CentOS系统中安装fftw，mpich，Lammps。

在win10中在virtualbox中安装CentOS的过程—— https://www.jianshu.com/p/e1791a8abb2d
linux指令学习—— https://www.runoob.com/linux/linux-file-content-manage.html
yum指令是什么—— https://wangchujiang.com/linux-command/c/yum.html
centos7 vim/vi的使用方法—— https://blog.csdn.net/capecape/article/details/78503497
centos下vi 命令用法—— https://www.cnblogs.com/winfosy/p/9478303.html
fftw是什么—— https://baike.baidu.com/item/FFTW/9974883?fr=aladdin
mpich是什么—— https://baike.baidu.com/item/MPICH/7488372?fr=aladdin
centos 下make命令的使用—— https://blog.csdn.net/programercch/article/details/56480168
Virtualbox主机和虚拟机之间文件夹共享及双向拷贝—— https://blog.csdn.net/zhaipengfei1231/article/details/78471038?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai2-1.channel_param&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai2-1.channel_param
VirtualBox中如何实现主机和虚拟机之间的文件拖放（Drag-and-Drop）—— https://www.crifan.com/summary_virtualbox_how_to_drap_and_drop_file_between_host_and_guest_vm/
Linux wget 命令用法详解—— https://www.jianshu.com/p/59bb131bc2ab
mpich安装（前面的准备工作千万要先做好！）—— https://blog.csdn.net/sinat_30967935/article/details/82988659
CentOS 7 安装gcc、g++、gdb教程—— https://blog.csdn.net/alan_gaohaodong/article/details/79656177
在CentOS下安装并行lammps教程—— https://tieba.baidu.com/p/5883557632?red_tag=3335137741
CentOS普通用户获得管理员权限—— https://blog.csdn.net/sy_bz/article/details/52399049

在这里衷心地感谢所有善良热心无私分享各种解决方案的作者！各位都是人间天使！